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女娲端坐在石座之上，目光如炬，凝视着前方的两人。
这两人，一位是颛顼，乃轩辕黄帝之孙；另一位是共工，乃炎帝之后，祝融之子。自从轩辕黄帝飞升天界之后，这天下共主之位便一直虚悬，于是这两人为了争夺王位，展开了一场激战，最终难分高下。此后，在听取自家大臣的建议后，他们一通前来，请女娲选定继任者。
“老祖宗，您可想好了？”两人齐声打断了女娲的沉思，女娲不禁皱了皱眉。她虽不喜欢被人称为“老”，但也并未发作。
女娲沉默片刻，缓声道：“颛顼，你聪慧过人，心地善良，正直无邪，且具备卓越的领导才能，在你的治理下，侯国繁荣昌盛，犹如繁花似锦。而共工，你虽勇猛善战，却过于专制跋扈，恰似狂风骤雨。”女娲用那灵动的蛇尾指向颛顼。
就这样，颛顼继承了王位，而共工当时愤愤不平，骂骂咧咧地走了。
过了些许时日，这一天，女娲正在午睡，忽听得一声惊天动地的巨响，她猛然惊醒，急忙问侍女发生了何事？“那共工驾驶着龙车，撞倒了天柱（不周山）！”侍女惊慌失措地说道。
女娲闻听此言，心中一惊，她深知共工性格刚烈，却未曾料到他竟会让出如此鲁莽之举。
她当即飞身前往天柱（不周山）查看状况，只见那巍峨的天柱（不周山）已然倒塌，天地之间陷入了一片混乱。大地倾斜，洪水如猛兽般肆虐，天上破开了一个巨大的窟窿，源源不断地有黑风呼啸涌出。
女娲目睹这一切，心中悲痛交加，愤怒如火山般喷涌。她看到大地上的百姓在洪水猛兽的威胁下四处奔逃，于是随手摘下一个葫芦，施展法术将其丢入水中。那葫芦瞬间变得如轮船般巨大，百姓们纷纷爬上葫芦避难。而后，女娲又挥舞着利剑，斩杀了趁机作乱的黑龙，紧接着便投入到补天的繁忙事务之中。
女娲不辞辛劳，东奔西走，在东方觅得青土，于西方寻得白土，往南方获取红土，至北方收获黑土，最终集齐黄土。而后，她从太上老君处借得一口大锅，从祝融处借来火种。将锅架设在不周山上，开始炼制补天石。历经七七四十九天，女娲的双手已然布记老茧，且开裂如龟甲，补天石终于大功告成。女娲将这些补天石镶嵌于天空，将天上的窟窿修补妥当。然而，有一块补天石坠落下来，这块补天石便被遗留在一座山上，随着岁月的流逝，渐渐拥有了灵性。后来，有一日，一僧一道云游至此，相互谈论着凡间的繁华盛景，灵石心生憧憬，恳请二者带它去凡间走一遭，此乃后话。
天虽已补好，但天柱缺失，天仍有塌陷之虞，于是女娲四处寻觅，终于找到一头L型巨大的乌龟，她手起刀落，将其斩杀，并卸下它的腿骨，以此作为新的天柱。
这黑龙和巨龟殒命之后，精魂始终在天地间徘徊游荡。真武大帝在武当山修行时，长期辟谷，不食五谷，腹中饥饿难耐，犹如万蚁噬心，令他心烦意乱，遂将肠子和肚子掏出，扔至身后的草丛之中。由于这肠子和肚子沾染了灵气，所以黑龙与巨龟的精魂便附身其上。肠子幻化成一条记身披挂鳞甲的长蛇，肚子则变成一只铁壳大乌龟。这龟蛇二怪起初在武当山兴风作浪，为非作歹，后来被真武大帝降服，并册封其为“龟蛇二将”。此亦为后话。
此后，女娲携手众神，共通治理洪水，围剿猛兽。历经千辛万苦，大规模洪水终于偃旗息鼓，但赤县神洲仍有小规模洪水肆虐，且不少野兽为非作歹。于是，天帝赐羿神弓，令其下界铲除以凿齿为首的异兽，又遣鲧下界辅佐尧舜治水。
至于那共工，当初他撞山之后，并未殒命，而是被生擒活捉。天帝将他的琵琶骨穿洞，用铁链锁住，将其囚禁在不周山下，以儆效尤。